A região que compreende como Vale do Mucuri começou a ser desbravada no decorrer do século XVI, em expedições que tinham como objetivo encontrar ouro e diamante, porém somente em 1853 é que chega ao lugar a chamada "Companhia de Comércio e Navegação do Mucuri", que tinha objetivo de povoar a região e era comandada por Teófilo Ottoni.
Teófilo Benedito Ottoni sonhava com que Minas Gerais pudesse ter um pedacinho do litoral brasileiro e por isso criou a via ferroviária conhecida como Estrada de Ferro Bahia a Minas, que ligava a cidade de Araçuaí, em Minas Gerais, até Caravelas, no estado da Bahia transportando cargas de madeira, visando o crescimento e desenvolvimento regional. Mas seu sonho não se concretizou, o Estado da Bahia resolveu tomar posse das terras onde hoje é considerado como o sul deste estado e Minas perdeu definitivamente um lugar próximo ao oceano.
Nanuque, antigo distrito criado em 1923 (denominado Indiana até 1943) foi elevado a categoria de município em 27 de dezembro de 1948 pela Lei n° 336.
Em Nanuque "bugre de cabelos negros" na definição de seu nome, já teve seus momentos de forte economia no setor madeireiro, com grandes empresas do ramo como a Brasil-Holanda que desfrutava de toda a madeira da região.
